El Dr. Eduardo Prado está activamente comprometido en la enseñanza de los estudiantes de pre- y post- grado en el Hospital Barros Luco Trudeau, que alberga el Campus Sur de la Facultad de Medicina de la Universidad de Chile, donde ocupa el cargo de Profesor Agregado.

Además realiza actividades de docencia y prevención en salud periocular a médicos en distintas comunidades rurales del territorio nacional y participa permanentemente como ponente en cursos y talleres dentro de América Latina, Europa y Asia.